UPS蓄電池的保護與一般低壓體系蓄電池的保護相似，當引入新電池時，要求工程驗收，進行深度放電;當新UPS電池投入運用后，要求保持適宜的電池作業環境溫度，要求按時丈量各電池端電壓，當各電池壓差過大時，要進行均充，要求按時對電池進行試探性容量實驗或深度放電，以便查看電池組的性能好壞以及保持電池的活性。

可是實踐運用中，因為各種條件的限制，UPS蓄電池的保護很少有人完全依照上面所述進行，首要新電池驗收，因為時間長，又無便利東西可供運用，有適當多的人底子沒有做這一作業行將電池投入運用，據統計，在我國大陸約有95%以上的UPS電池缺乏必要的保護，這為日后UPS供電毛病埋下隱患;其次，新電池投入運用后，因為一般UPS電池是裝在柜子里，丈量、脫離都不便利，很少丈量端電壓，按時深度放電更是無從進行。

依現有條件，廣大保護人員所能進行的只有每隔一段時間，封閉市電讓UPS電池對實踐體系放電一段時間，充其量只是讓電池組活化一下，以保持電池的活性，而關于電池的性能好壞及各節電池的剩下容量等重要數據仍是無從知曉。