1.按燃料動力電池的運行機理分。

分為酸性燃料動力電池和堿性燃料動力電池。

2.按電解質的種類不同，有酸性、堿性、熔融鹽類或固體電解質。

因此，燃料動力電池可分為堿性燃料動力電池（AFC）、磷酸燃料動力電池（PAFC）、熔融碳酸鹽燃料動力電池(MCFC)、固體氧化物燃料動力電池（SOFC）、質子交換膜燃料動力電池（PEMFC）等。在燃料動力電池中，磷酸燃料動力電池(PAFC)、質子交換膜燃料動力電池（PEMFC）可以冷起動和快起動，可以用作為移動電源，適應FCEV使用的要求，更加具有競爭力。

3.按燃料類型分。

有氫氣、甲醇、甲烷、乙烷、甲苯、丁烯、丁烷等有機燃料，汽油、柴油和天然氣等氣體燃料，有機燃料和氣體燃料必須經過重整器重整為氫氣后，才能成為燃料動力電池的燃料。

4.按燃料動力電池工作溫度分。

有低溫型，溫度低于200℃；中溫型，溫度為200～750℃；高溫型，溫度高于750℃。

在常溫下工作的燃料動力電池，例如質子交換膜燃料動力電池（PEMFC），這類燃料動力電池要采用貴金屬作為催化劑。燃料的化學能絕大部分都能轉化為電能，只出現少量的廢熱和水，不出現污染大氣環境的氮氧化物。不要廢熱能量回收裝置，體積較小，質量較輕。但催化劑鉑（Pt）會與工作介質中的一氧化碳（CO）發生用途后出現"中毒"現象而失效，使燃料動力電池效率降低或完全損壞。而且鉑（Pt）的價格很高，新增了燃料動力電池的成本。

另一類是在高溫（600～1000℃）下工作的燃料動力電池，例如熔融碳酸鹽燃料動力電池（MCFC）和固體氧化物燃料動力電池（SOFC），這類的燃料動力電池不要采用貴金屬作為催化劑。但由于工作溫度高，要采用復合廢熱回收裝置來利用廢熱，體積大，質量重，只適合用于大功率的發電廠中。

最實用的燃料動力電池是以氫或含富氫的氣體燃料，但是在自然界是不能直接獲得氫的，燃料動力電池氫的；來源通常是以石油燃料、甲醇、乙醇、沼氣、天然氣、石腦油和煤氣中，經過重整、裂解等化學處理后來制取含富氫的氣體燃料。氧化劑則采用氧氣或空氣，最常見的是用空氣作為氧化劑。檢舉回答人的補充2009-10-2209:10燃料動力電池十分復雜，涉及化學熱力學、電化學、電催化、材料科學、電力系統及自動控制等學科的有關理論，具有發電效率高、環境污染少等優點。